Ayşe Derya Cavga

Dr. Ayşe Derya Cavga, lisans ve yüksek lisans eğitimini Bilkent Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü’nde tamamladı, Dr. Mehmet Öztürk’ün laboratuvarında karaciğer kanseri üzerine çalıştı. Daha sonra doktorasını Koç Üniversitesi Hesaplamalı Sistem Biyolojisi (COSBI) Laboratuvarı’nda Dr. Özlem Keskin, Dr. Attila Gürsoy ve Dr. Nathan Lack’in danışmanlığında tamamladı. Doktora çalışmalarında prostat kanseri ve sirkadiyen saat modelleri üzerinde, transkripsiyon faktörlerinin protein-protein etkileşimleri, RNA-protein etkileşimleri ve gen ifadesini düzenleyici etkileri üzerinde çalıştı. ABD’de Ulusal Kanser Enstitüsü’nde, Vancouver’da British Columbia Kanser Araştırma Merkezi’nde ve Brüksel’de ULB Diyabet Araştırmaları Merkezi’nde misafir araştırmacı olarak çalıştı. Doktora sonrası araştırmalarında bir biyoinformatikçi olarak Dr. Tuğba Bağcı Önder, Dr. Tamer Önder ve Dr. Nathan Lack’in laboratuvarlarında elde edilen yeni nesil sekans verileri üzerinde çalışıyor, ve multi-omics yaklaşımlı bir proje geliştiriyor.

Öne Çıkan Makaleler

  • Cavga AD, Tardu M, Korkmaz T, Keskin O, Ozturk N, Gursoy A, Kavakli IH. Cryptochrome deletion in p53 mutant mice enhances apoptotic and anti-tumorigenic responses to UV damage at the transcriptome level. Funct Integr Genomics. 2019 Sep;19(5):729-742. doi: 10.1007/s10142-019-00680-5
  • Cavga AD, Karahan N, Keskin O, Gursoy A. Taming Oncogenic Signaling at Protein Interfaces: Challenges and Opportunities. Curr Top Med Chem. 2015;15(20):2005-18. doi: 10.2174/1568026615666150519101956
  • Pooley JR, Rivers CA, Kilcooley MT, Paul SN, Cavga AD, Kershaw YM, Muratcioglu S, Gursoy A, Keskin O, Lightman SL. Beyond the heterodimer model for mineralocorticoid and glucocorticoid receptor interactions in nuclei and at DNA. PLoS One. 2020 Jan 10;15(1):e0227520. doi: 10.1371/journal.pone.0227520
  • Woo G, Fernandez M, Hsing M, Lack NA, Cavga AD, Cherkasov A. DeepCOP: deep learning-based approach to predict gene regulating effects of small molecules. Bioinformatics. 2020 Feb 1;36(3):813-818. doi: 10.1093/bioinformatics/btz645